Christoph Schönbron naît le 22 janvier 1945 à Skalken, dans le diocèse de Litomerice, en Bohème (actuelle République tchèque). Il habite en Autriche dès septembre 1945. Il étudie à Schruns et Bludenz (Voralberg). En 1963, il entre chez les dominicains. Il commence ses études supérieures dans une école de l'Ordre à Walberberg, près de Bonn, pour la philosophie et la théologie, et au Saulchoir en France (théologie), puis à l'Université de Vienne (philosophie et psychologie), à l'École pratique des Hautes Études, à la Sorbonne (christianisme slave et byzantin) et à l'Institut catholique (théologie), à Paris. Il est ordonné prêtre le 27 décembre 1970. Il obtient la licence et le lectorat en théologie en 1971, puis le doctorat à Paris en 1974.
Il est aumônier des étudiants à Graz de 1973 à 1975 , puis devient professeur extraordinaire de dogmatique à l'Université de Fribourg (Suisse). À partir de 1978, il est professeur auxiliaire de théologie chrétienne orientale, et professeur de dogmatique de 1981 à 1991. Il est aussi appelé dans différentes commissions d'experts : commission théologique de la conférence épiscopale suisse (1980-1991), commission suisse pour le dialogue entre orthodoxes et catholiques (1980-1987), commission pour le dialogue entre catholiques romains et autres chrétiens (1980-1984). Mais surtout, il est membre de la commission théologique inter-nationale à partir de 1980 et de la Fondation Pro Oriente, depuis 1984. Il assume la responsabilité de secrétaire de la commission pour la rédaction du Catéchisme de l'Église catholique (1987-1992).
Jean-Paul II le nomme évêque auxiliaire de Vienne, le 11 juillet 1991, puis archevêque coadjuteur, le 13 avril 1995. Il succède au cardinal Groër dès le 14 septembre 1995. Il prêche les exercices spirituels au Vatican pour le carême 1996. Il est élu président de la conférence épiscopale autrichienne en juin 1998. Il est l'auteur d'un grand nombre d'ouvrages et de nombreuses interventions sur les questions européennes. Il est créé cardinal par le pape le 21 février 1998